Центральная научно-исследовательская лаборатория (ЦНИЛ) уделяет большое внимание контролю качества лабораторных исследований

Лаборатория с 2003 года является участницей Федеральной системы внешней оценки качества клинических лабораторных исследований (ФСВОК)

Кроме того большое внимание уделяется внутрилабораторному контролю качества.

Для этого используется программа ''Altey'' версия 5.0. В качестве контрольных материалов используются материалы фирмы ''Bio-Rad'' (ИФА, гематология, общий анализ мочи); ''ИнтерЛабСервис'' (ПЦР диагностика половых ифекций); ''Вектор-Бест'' (HBsAg, HCV, ИФА токсоплазмоз, ИФА описторхоз)

В 2006 году в рамках ФСВОК Центральная научно-исследовательская лаборатория (ЦНИЛ) принимала участие в международной программе контроля качества по HBsAg

В июле 2012 года Центральная научно-исследовательская лаборатория (ЦНИЛ) приняла участие в межлабораторных сравнительных испытаниях ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора и получила высокие результаты